Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDR2Q01850 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDR2Q01850 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDR2Q01850 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms