Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SATB1Q01826 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SATB1Q01826 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms