Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL1Q00532 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKL1Q00532 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKL1Q00532 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms