Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDLBPQ00341 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDLBPQ00341 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDLBPQ00341 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms