Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD3P84022 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAD3P84022 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms