Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUCB2P80303 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUCB2P80303 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms