Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IRX6P78412 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IRX6P78412 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IRX6P78412 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IRX6P78412 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IRX6P78412 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IRX6P78412 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
IRX6P78412 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IRX6P78412 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IRX6P78412 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IRX6P78412 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
IRX6P78412 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
IRX6P78412 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
IRX6P78412 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
IRX6P78412 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX6P78412 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX6P78412 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX6P78412 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX6P78412 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX6P78412 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX6P78412 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX6P78412 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX6P78412 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX6P78412 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRX6P78412 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRX6P78412 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRX6P78412 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRX6P78412 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRX6P78412 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRX6P78412 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRX6P78412 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRX6P78412 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX6P78412 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX6P78412 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX6P78412 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX6P78412 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX6P78412 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX6P78412 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX6P78412 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX6P78412 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX6P78412 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX6P78412 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX6P78412 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX6P78412 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX6P78412 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX6P78412 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX6P78412 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX6P78412 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX6P78412 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX6P78412 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX6P78412 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX6P78412 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX6P78412 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX6P78412 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX6P78412 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX6P78412 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX6P78412 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX6P78412 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX6P78412 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX6P78412 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX6P78412 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX6P78412 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX6P78412 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX6P78412 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX6P78412 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX6P78412 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX6P78412 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IRX6P78412 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IRX6P78412 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IRX6P78412 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IRX6P78412 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IRX6P78412 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IRX6P78412 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IRX6P78412 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IRX6P78412 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IRX6P78412 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IRX6P78412 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IRX6P78412 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IRX6P78412 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IRX6P78412 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IRX6P78412 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX6P78412 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IRX6P78412 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IRX6P78412 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IRX6P78412 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IRX6P78412 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX6P78412 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX6P78412 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX6P78412 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms