Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V0D1P61421 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0D1P61421 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms