Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00315P59091 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00315P59091 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms