Protein–RNA interactions for Protein: P58005

SESN3, Sestrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3P58005 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SESN3P58005 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SESN3P58005 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SESN3P58005 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SESN3P58005 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SESN3P58005 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SESN3P58005 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SESN3P58005 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SESN3P58005 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SESN3P58005 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SESN3P58005 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SESN3P58005 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SESN3P58005 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SESN3P58005 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SESN3P58005 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SESN3P58005 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SESN3P58005 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SESN3P58005 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SESN3P58005 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SESN3P58005 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SESN3P58005 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SESN3P58005 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SESN3P58005 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SESN3P58005 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SESN3P58005 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SESN3P58005 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SESN3P58005 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SESN3P58005 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SESN3P58005 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SESN3P58005 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SESN3P58005 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SESN3P58005 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SESN3P58005 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SESN3P58005 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SESN3P58005 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SESN3P58005 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SESN3P58005 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SESN3P58005 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SESN3P58005 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SESN3P58005 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SESN3P58005 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SESN3P58005 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SESN3P58005 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SESN3P58005 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SESN3P58005 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SESN3P58005 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SESN3P58005 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SESN3P58005 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SESN3P58005 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SESN3P58005 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms