Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP1S2P56377 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP1S2P56377 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP1S2P56377 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms