Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTSWP56202 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTSWP56202 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CTSWP56202 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTSWP56202 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CTSWP56202 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CTSWP56202 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CTSWP56202 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CTSWP56202 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CTSWP56202 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CTSWP56202 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTSWP56202 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTSWP56202 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTSWP56202 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTSWP56202 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTSWP56202 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTSWP56202 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTSWP56202 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTSWP56202 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTSWP56202 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTSWP56202 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTSWP56202 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTSWP56202 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTSWP56202 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTSWP56202 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTSWP56202 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTSWP56202 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTSWP56202 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CTSWP56202 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTSWP56202 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTSWP56202 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTSWP56202 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTSWP56202 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTSWP56202 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTSWP56202 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTSWP56202 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CTSWP56202 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CTSWP56202 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTSWP56202 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTSWP56202 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTSWP56202 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTSWP56202 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTSWP56202 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTSWP56202 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTSWP56202 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTSWP56202 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTSWP56202 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTSWP56202 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTSWP56202 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTSWP56202 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CTSWP56202 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTSWP56202 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTSWP56202 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTSWP56202 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTSWP56202 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTSWP56202 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTSWP56202 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTSWP56202 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTSWP56202 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTSWP56202 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTSWP56202 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTSWP56202 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTSWP56202 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTSWP56202 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTSWP56202 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTSWP56202 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTSWP56202 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTSWP56202 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CTSWP56202 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTSWP56202 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTSWP56202 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTSWP56202 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTSWP56202 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTSWP56202 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CTSWP56202 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTSWP56202 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTSWP56202 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTSWP56202 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTSWP56202 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTSWP56202 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTSWP56202 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTSWP56202 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTSWP56202 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTSWP56202 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTSWP56202 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTSWP56202 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTSWP56202 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTSWP56202 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTSWP56202 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms