Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP9P55211 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP9P55211 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP9P55211 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP9P55211 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP9P55211 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP9P55211 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP9P55211 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP9P55211 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP9P55211 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP9P55211 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP9P55211 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP9P55211 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP9P55211 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP9P55211 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP9P55211 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP9P55211 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP9P55211 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP9P55211 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP9P55211 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP9P55211 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP9P55211 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP9P55211 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP9P55211 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP9P55211 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP9P55211 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP9P55211 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP9P55211 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP9P55211 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP9P55211 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP9P55211 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP9P55211 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP9P55211 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP9P55211 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP9P55211 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP9P55211 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP9P55211 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP9P55211 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP9P55211 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP9P55211 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP9P55211 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP9P55211 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP9P55211 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP9P55211 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP9P55211 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP9P55211 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP9P55211 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP9P55211 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP9P55211 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP9P55211 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP9P55211 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP9P55211 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP9P55211 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP9P55211 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP9P55211 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP9P55211 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP9P55211 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP9P55211 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP9P55211 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP9P55211 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP9P55211 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP9P55211 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP9P55211 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP9P55211 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP9P55211 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP9P55211 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP9P55211 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP9P55211 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP9P55211 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP9P55211 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP9P55211 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP9P55211 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP9P55211 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP9P55211 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP9P55211 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP9P55211 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP9P55211 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP9P55211 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASP9P55211 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASP9P55211 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASP9P55211 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP9P55211 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP9P55211 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP9P55211 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP9P55211 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP9P55211 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP9P55211 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms