Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIMK2P53671 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIMK2P53671 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms