Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK1P53667 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK1P53667 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIMK1P53667 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms