Protein–RNA interactions for Protein: P52943

CRIP2, Cysteine-rich protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2P52943 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP2P52943 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP2P52943 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRIP2P52943 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP2P52943 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms