Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LUMP51884 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LUMP51884 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LUMP51884 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LUMP51884 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LUMP51884 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LUMP51884 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LUMP51884 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LUMP51884 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LUMP51884 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LUMP51884 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LUMP51884 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LUMP51884 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LUMP51884 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LUMP51884 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LUMP51884 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LUMP51884 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LUMP51884 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LUMP51884 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LUMP51884 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LUMP51884 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LUMP51884 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LUMP51884 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LUMP51884 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LUMP51884 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LUMP51884 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LUMP51884 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LUMP51884 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LUMP51884 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LUMP51884 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LUMP51884 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LUMP51884 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LUMP51884 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LUMP51884 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LUMP51884 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LUMP51884 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LUMP51884 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LUMP51884 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LUMP51884 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LUMP51884 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LUMP51884 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LUMP51884 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LUMP51884 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LUMP51884 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LUMP51884 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LUMP51884 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LUMP51884 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LUMP51884 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LUMP51884 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms