Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR8P51685 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR8P51685 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR8P51685 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR8P51685 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR8P51685 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR8P51685 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR8P51685 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR8P51685 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR8P51685 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR8P51685 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR8P51685 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR8P51685 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR8P51685 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR8P51685 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR8P51685 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR8P51685 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR8P51685 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR8P51685 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCR8P51685 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCR8P51685 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCR8P51685 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR8P51685 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR8P51685 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR8P51685 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR8P51685 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR8P51685 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR8P51685 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR8P51685 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR8P51685 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR8P51685 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR8P51685 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR8P51685 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR8P51685 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR8P51685 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR8P51685 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR8P51685 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR8P51685 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR8P51685 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR8P51685 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR8P51685 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR8P51685 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR8P51685 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR8P51685 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR8P51685 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR8P51685 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR8P51685 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR8P51685 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR8P51685 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR8P51685 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR8P51685 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR8P51685 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR8P51685 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR8P51685 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR8P51685 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR8P51685 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR8P51685 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR8P51685 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR8P51685 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR8P51685 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR8P51685 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR8P51685 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR8P51685 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR8P51685 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR8P51685 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR8P51685 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR8P51685 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCR8P51685 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR8P51685 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR8P51685 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR8P51685 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR8P51685 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR8P51685 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR8P51685 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR8P51685 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR8P51685 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR8P51685 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR8P51685 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR8P51685 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR8P51685 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR8P51685 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR8P51685 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR8P51685 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR8P51685 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR8P51685 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR8P51685 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR8P51685 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR8P51685 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR8P51685 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR8P51685 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR8P51685 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR8P51685 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR8P51685 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR8P51685 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR8P51685 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR8P51685 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR8P51685 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR8P51685 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR8P51685 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR8P51685 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms