Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DAP3P51398 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DAP3P51398 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DAP3P51398 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DAP3P51398 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DAP3P51398 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DAP3P51398 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DAP3P51398 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DAP3P51398 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DAP3P51398 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DAP3P51398 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DAP3P51398 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DAP3P51398 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DAP3P51398 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DAP3P51398 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DAP3P51398 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
DAP3P51398 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DAP3P51398 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DAP3P51398 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DAP3P51398 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DAP3P51398 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DAP3P51398 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DAP3P51398 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DAP3P51398 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DAP3P51398 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DAP3P51398 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DAP3P51398 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DAP3P51398 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DAP3P51398 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DAP3P51398 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DAP3P51398 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DAP3P51398 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DAP3P51398 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DAP3P51398 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DAP3P51398 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DAP3P51398 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DAP3P51398 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DAP3P51398 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DAP3P51398 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DAP3P51398 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DAP3P51398 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DAP3P51398 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DAP3P51398 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DAP3P51398 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DAP3P51398 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DAP3P51398 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DAP3P51398 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DAP3P51398 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DAP3P51398 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DAP3P51398 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DAP3P51398 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DAP3P51398 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DAP3P51398 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DAP3P51398 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DAP3P51398 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DAP3P51398 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DAP3P51398 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DAP3P51398 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DAP3P51398 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DAP3P51398 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DAP3P51398 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DAP3P51398 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DAP3P51398 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DAP3P51398 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms