Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCNN1BP51168 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1BP51168 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCNN1BP51168 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms