Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8P50990 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8P50990 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT8P50990 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT8P50990 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT8P50990 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT8P50990 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT8P50990 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCT8P50990 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8P50990 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8P50990 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8P50990 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8P50990 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8P50990 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8P50990 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8P50990 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8P50990 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8P50990 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCT8P50990 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT8P50990 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT8P50990 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT8P50990 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCT8P50990 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8P50990 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8P50990 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8P50990 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8P50990 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8P50990 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8P50990 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8P50990 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8P50990 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCT8P50990 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8P50990 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8P50990 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8P50990 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8P50990 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8P50990 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8P50990 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8P50990 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8P50990 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8P50990 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8P50990 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT8P50990 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8P50990 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8P50990 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8P50990 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8P50990 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8P50990 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8P50990 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8P50990 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8P50990 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8P50990 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8P50990 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8P50990 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8P50990 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8P50990 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8P50990 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8P50990 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8P50990 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8P50990 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8P50990 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8P50990 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8P50990 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8P50990 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8P50990 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8P50990 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8P50990 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8P50990 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8P50990 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8P50990 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8P50990 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8P50990 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8P50990 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8P50990 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8P50990 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8P50990 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8P50990 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8P50990 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8P50990 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8P50990 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8P50990 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8P50990 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8P50990 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8P50990 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8P50990 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8P50990 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8P50990 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8P50990 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8P50990 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8P50990 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8P50990 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8P50990 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8P50990 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8P50990 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8P50990 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8P50990 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8P50990 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8P50990 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT8P50990 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT8P50990 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms