Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSNK1EP49674 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms