Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FNTAP49354 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNTAP49354 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FNTAP49354 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTAP49354 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTAP49354 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FNTAP49354 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTAP49354 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTAP49354 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTAP49354 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTAP49354 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTAP49354 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTAP49354 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTAP49354 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTAP49354 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FNTAP49354 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNTAP49354 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FNTAP49354 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTAP49354 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTAP49354 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTAP49354 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTAP49354 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTAP49354 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTAP49354 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTAP49354 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTAP49354 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTAP49354 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTAP49354 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FNTAP49354 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTAP49354 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTAP49354 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTAP49354 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTAP49354 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTAP49354 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTAP49354 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTAP49354 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTAP49354 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FNTAP49354 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTAP49354 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTAP49354 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTAP49354 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTAP49354 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTAP49354 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTAP49354 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FNTAP49354 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNTAP49354 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNTAP49354 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNTAP49354 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FNTAP49354 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNTAP49354 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FNTAP49354 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTAP49354 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTAP49354 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTAP49354 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTAP49354 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTAP49354 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTAP49354 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTAP49354 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FNTAP49354 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNTAP49354 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNTAP49354 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNTAP49354 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNTAP49354 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNTAP49354 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FNTAP49354 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTAP49354 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTAP49354 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTAP49354 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTAP49354 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTAP49354 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTAP49354 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTAP49354 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FNTAP49354 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNTAP49354 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNTAP49354 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FNTAP49354 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FNTAP49354 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNTAP49354 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNTAP49354 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNTAP49354 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FNTAP49354 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FNTAP49354 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FNTAP49354 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms