Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POU3F4P49335 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POU3F4P49335 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms