Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNNI2P48788 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNNI2P48788 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNI2P48788 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms