Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRA4P48169 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms