Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPA2P48052 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA2P48052 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA2P48052 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA2P48052 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA2P48052 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA2P48052 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA2P48052 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA2P48052 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA2P48052 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA2P48052 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA2P48052 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA2P48052 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA2P48052 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA2P48052 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA2P48052 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA2P48052 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA2P48052 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA2P48052 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA2P48052 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA2P48052 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA2P48052 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA2P48052 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA2P48052 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA2P48052 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA2P48052 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA2P48052 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA2P48052 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA2P48052 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA2P48052 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA2P48052 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA2P48052 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA2P48052 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA2P48052 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA2P48052 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA2P48052 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA2P48052 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA2P48052 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA2P48052 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA2P48052 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA2P48052 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA2P48052 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA2P48052 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA2P48052 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA2P48052 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA2P48052 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA2P48052 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA2P48052 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA2P48052 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA2P48052 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA2P48052 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA2P48052 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA2P48052 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA2P48052 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA2P48052 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA2P48052 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA2P48052 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA2P48052 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA2P48052 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA2P48052 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPA2P48052 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPA2P48052 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPA2P48052 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA2P48052 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms