Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALDH1A3P47895 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH1A3P47895 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALDH1A3P47895 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH1A3P47895 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms