Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEDD4P46934 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD4P46934 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms