Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GNPDA1P46926 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GNPDA1P46926 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms