Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGIRP43119 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTGIRP43119 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGIRP43119 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms