Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACAA2P42765 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACAA2P42765 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms