Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIK3CAP42336 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIK3CAP42336 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CAP42336 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms