Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX19P40855 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX19P40855 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX19P40855 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX19P40855 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX19P40855 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX19P40855 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX19P40855 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX19P40855 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX19P40855 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX19P40855 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX19P40855 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX19P40855 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX19P40855 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX19P40855 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX19P40855 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX19P40855 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX19P40855 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX19P40855 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX19P40855 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX19P40855 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX19P40855 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX19P40855 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX19P40855 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX19P40855 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX19P40855 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX19P40855 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX19P40855 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX19P40855 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX19P40855 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX19P40855 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX19P40855 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX19P40855 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX19P40855 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX19P40855 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX19P40855 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX19P40855 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX19P40855 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX19P40855 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX19P40855 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX19P40855 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX19P40855 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX19P40855 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX19P40855 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX19P40855 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX19P40855 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX19P40855 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX19P40855 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX19P40855 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX19P40855 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX19P40855 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX19P40855 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX19P40855 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX19P40855 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX19P40855 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX19P40855 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX19P40855 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX19P40855 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX19P40855 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX19P40855 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX19P40855 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX19P40855 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX19P40855 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX19P40855 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX19P40855 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX19P40855 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX19P40855 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX19P40855 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX19P40855 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX19P40855 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms