Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP8P40818 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP8P40818 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP8P40818 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP8P40818 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP8P40818 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP8P40818 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP8P40818 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP8P40818 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP8P40818 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP8P40818 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP8P40818 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP8P40818 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP8P40818 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP8P40818 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP8P40818 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP8P40818 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP8P40818 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP8P40818 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP8P40818 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP8P40818 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP8P40818 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP8P40818 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP8P40818 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP8P40818 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP8P40818 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP8P40818 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP8P40818 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP8P40818 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP8P40818 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP8P40818 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP8P40818 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP8P40818 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP8P40818 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP8P40818 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP8P40818 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP8P40818 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP8P40818 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP8P40818 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP8P40818 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP8P40818 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP8P40818 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP8P40818 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP8P40818 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP8P40818 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP8P40818 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP8P40818 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP8P40818 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP8P40818 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP8P40818 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP8P40818 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP8P40818 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP8P40818 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP8P40818 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP8P40818 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP8P40818 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP8P40818 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP8P40818 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP8P40818 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP8P40818 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP8P40818 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP8P40818 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP8P40818 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP8P40818 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP8P40818 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP8P40818 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP8P40818 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP8P40818 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP8P40818 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP8P40818 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP8P40818 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP8P40818 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP8P40818 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP8P40818 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP8P40818 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP8P40818 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP8P40818 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP8P40818 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP8P40818 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP8P40818 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP8P40818 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP8P40818 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP8P40818 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP8P40818 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP8P40818 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP8P40818 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP8P40818 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP8P40818 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP8P40818 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms