Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYLC1P35663 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CYLC1P35663 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.6 ms