Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDIT3P35638 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms