Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBSP35520 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CBSP35520 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBSP35520 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBSP35520 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBSP35520 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBSP35520 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBSP35520 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CBSP35520 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBSP35520 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBSP35520 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBSP35520 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBSP35520 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBSP35520 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBSP35520 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBSP35520 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBSP35520 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBSP35520 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBSP35520 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBSP35520 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBSP35520 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBSP35520 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBSP35520 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBSP35520 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBSP35520 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBSP35520 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBSP35520 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBSP35520 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBSP35520 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBSP35520 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CBSP35520 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBSP35520 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBSP35520 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBSP35520 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CBSP35520 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBSP35520 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBSP35520 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBSP35520 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBSP35520 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBSP35520 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBSP35520 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBSP35520 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBSP35520 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBSP35520 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CBSP35520 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBSP35520 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBSP35520 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBSP35520 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBSP35520 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBSP35520 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CBSP35520 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBSP35520 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBSP35520 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBSP35520 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBSP35520 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBSP35520 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBSP35520 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBSP35520 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBSP35520 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBSP35520 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBSP35520 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBSP35520 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBSP35520 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBSP35520 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBSP35520 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBSP35520 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBSP35520 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBSP35520 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CBSP35520 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBSP35520 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBSP35520 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBSP35520 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBSP35520 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBSP35520 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBSP35520 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBSP35520 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CBSP35520 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBSP35520 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBSP35520 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBSP35520 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBSP35520 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBSP35520 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBSP35520 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBSP35520 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBSP35520 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBSP35520 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBSP35520 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBSP35520 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBSP35520 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms