Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCVRNP35243 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCVRNP35243 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCVRNP35243 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms