Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGER1P34995 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGER1P34995 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTGER1P34995 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms