Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
L1CAMP32004 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
L1CAMP32004 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L1CAMP32004 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms