Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA9P31269 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA9P31269 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms