Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC25CP30307 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC25CP30307 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC25CP30307 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms