Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP1P29466 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP1P29466 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP1P29466 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CASP1P29466 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASP1P29466 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASP1P29466 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP1P29466 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP1P29466 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP1P29466 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP1P29466 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP1P29466 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP1P29466 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP1P29466 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP1P29466 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASP1P29466 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP1P29466 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP1P29466 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP1P29466 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP1P29466 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP1P29466 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP1P29466 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP1P29466 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP1P29466 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP1P29466 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASP1P29466 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP1P29466 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP1P29466 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP1P29466 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP1P29466 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP1P29466 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP1P29466 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASP1P29466 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASP1P29466 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASP1P29466 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP1P29466 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP1P29466 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP1P29466 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP1P29466 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP1P29466 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP1P29466 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP1P29466 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP1P29466 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP1P29466 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP1P29466 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASP1P29466 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP1P29466 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP1P29466 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP1P29466 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP1P29466 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP1P29466 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP1P29466 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP1P29466 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP1P29466 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP1P29466 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP1P29466 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP1P29466 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP1P29466 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP1P29466 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP1P29466 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP1P29466 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP1P29466 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP1P29466 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP1P29466 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP1P29466 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP1P29466 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP1P29466 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP1P29466 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP1P29466 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP1P29466 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP1P29466 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP1P29466 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP1P29466 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP1P29466 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP1P29466 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP1P29466 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP1P29466 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP1P29466 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP1P29466 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP1P29466 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP1P29466 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP1P29466 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP1P29466 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP1P29466 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP1P29466 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP1P29466 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP1P29466 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP1P29466 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP1P29466 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms