Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPHA3P29320 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHA3P29320 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms