Protein–RNA interactions for Protein: P28324

ELK4, ETS domain-containing protein Elk-4, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK4P28324 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELK4P28324 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELK4P28324 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELK4P28324 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELK4P28324 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK4P28324 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK4P28324 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK4P28324 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK4P28324 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK4P28324 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK4P28324 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK4P28324 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK4P28324 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELK4P28324 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELK4P28324 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELK4P28324 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELK4P28324 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELK4P28324 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELK4P28324 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELK4P28324 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELK4P28324 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELK4P28324 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ELK4P28324 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ELK4P28324 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK4P28324 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK4P28324 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK4P28324 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK4P28324 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK4P28324 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK4P28324 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELK4P28324 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ELK4P28324 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK4P28324 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK4P28324 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK4P28324 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK4P28324 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK4P28324 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK4P28324 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ELK4P28324 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK4P28324 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK4P28324 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK4P28324 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK4P28324 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK4P28324 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK4P28324 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK4P28324 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELK4P28324 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELK4P28324 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELK4P28324 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELK4P28324 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELK4P28324 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ELK4P28324 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELK4P28324 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELK4P28324 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELK4P28324 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK4P28324 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK4P28324 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK4P28324 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK4P28324 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK4P28324 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK4P28324 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK4P28324 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELK4P28324 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK4P28324 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK4P28324 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK4P28324 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK4P28324 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK4P28324 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK4P28324 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK4P28324 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK4P28324 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK4P28324 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK4P28324 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELK4P28324 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELK4P28324 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms