Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4AP27815 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4AP27815 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4AP27815 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms