Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRYBB3P26998 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CRYBB3P26998 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms