Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCHP24723 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKCHP24723 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms