Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME2P23368 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME2P23368 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME2P23368 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME2P23368 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME2P23368 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME2P23368 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME2P23368 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME2P23368 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME2P23368 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME2P23368 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ME2P23368 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME2P23368 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME2P23368 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME2P23368 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME2P23368 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ME2P23368 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ME2P23368 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME2P23368 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME2P23368 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME2P23368 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ME2P23368 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ME2P23368 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ME2P23368 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME2P23368 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME2P23368 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME2P23368 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME2P23368 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME2P23368 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ME2P23368 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME2P23368 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME2P23368 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ME2P23368 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME2P23368 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME2P23368 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME2P23368 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME2P23368 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ME2P23368 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME2P23368 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME2P23368 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME2P23368 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME2P23368 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME2P23368 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME2P23368 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ME2P23368 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME2P23368 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME2P23368 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME2P23368 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms